El Laboratorio es pionero en el empleo de bacterias lácticas probióticas inmunomoduladoras (inmunobióticos) y sus fracciones celulares para incrementar las defensas respiratorias, tanto en huéspedes inmunocompetentes como en inmunocomprometidos. Se dedica a la investigación y desarrollo de nuevos productos inmunobióticos destinados al tratamiento y prevención de enfermedades infecciosas respiratorias bacterianas y virales. El grupo de trabajo ha hecho aportes significativos al conocimiento de los efectos beneficiosos de los inmunobióticos en la inmunidad de la mucosa respiratoria. Asimismo, se estudian sistemas fisiológicos estrechamente relacionados con la respuesta inmune, tales como los sistemas hematopoyético y hemostático. Recientemente se incorporó una línea de investigación sobre los efectos inmunomoduladores en enfermedades inflamatorias hepáticas. El estudio de las interacciones celulares y moleculares de las bacterias lácticas y sus moléculas inmunomoduladoras con las células del huésped ha contribuido significativamente al entendimiento del modo de acción de los microorganismos immunobióticos. El laboratorio mantiene estrecho contacto con grupos de investigación internacionales como Japón, Chile, Rusia y Estados Unidos, para colaborar en la investigación de los mecanismos involucrados en sus efectos.
Algunas de las investigaciones básicas del grupo de inmunobiotecnología fueron transferidas exitosamente al sector socio-productivo en forma de alimentos probióticos sociales, como Yogurito y Chocolet.