El laboratorio investiga aspectos fisiológicos de diferentes poblaciones bacterianas en ecosistemas naturales, como punto de partida en la selección de microorganismos con capacidad para la transformación de matrices lácteas o vegetales, actividad detoxificante y producción de compuestos bioactivos, o con capacidad para actuar como probióticos mediante la modulación de la microbiota intestinal y actividades metabólicas del hospedador. Se desarrollan tecnologías de producción que preserven las propiedades de los microorganismos para el diseño de nuevos productos alimenticios funcionales para el hombre y animales.

Algunos resultados exitosos fueron transferidos al sector productivo, como Leche SANCOR-Bio, SANCOR Bio-fructanos y BIOFLORA (SIDUS).

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